Письмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ от 23 марта 2012 г. N  03-05-04-03/23 Об освобождении от уплаты государственной пошлины федеральных органов государственной власти, органов государственной власти субъектов РФ и органов местного самоуправления при их обращении за совершением юридически значимых действий [обратиться к тексту документа]

Органы государственной власти (федеральные и региональные) и местного самоуправления освобождаются от госпошлины за совершение любых юридически значимых действий. Исключение - госпошлина за принятие решения по разногласиям, касающимся госрегулирования тарифов и надбавок.

К федеральным органам исполнительной власти не относятся подведомственные им учреждения.

Таким образом, учреждения, подведомственные органам государственной власти и местного самоуправления, не освобождаются от госпошлины.

Территориальные органы федеральных ведомств и региональных органов должны освобождаться от госпошлины.